东大有很多学院，每个学院下面又有很多学科，因此专业是非常多的。 人文社会科學研究院 教育学研究科 法学政治学研究科 经济学研究科 经营学研究科 理学研究科 工学研究科 农学研究科 医学部（包含附属病院） 药学部 海洋工學院 环境能源研究科 情报理工研究科
以上只是部分学科，完整的学科清单请见： 想要了解哪个学科的科研实力、师资力量、奖学金等情况，可以在知乎里搜索「東大 学部 学科」，比如想要了解经济学相关，就可以搜索「東大 经济学 学科」。
东大的文科和理科的招生方法是不同的，这里只讨论理工科的情况。理工科录取比例一般低于3%，个别学院甚至可以达到10：1或者更高。因此能考进东大理工科的研究生其实非常不容易。
在研究生期间，学生需要修完规定的学分并且通过博士课程选拔才能进入博士课程阶段（当然也可以选择不读博士课程直接毕业）。博士课程每年4月入学，秋季考试，冬季出结果，如果考试合格就能入学了。
彭丽娜优质答主就文科而言，东京大学下设：文学部、理学部、法学部、经济学部、教育学部、教养学部、农学部、工学部、医学部、综合文化研究科、新领域创成科学研究科共2个大学院。其中有6个学部是本科毕业生考研的考试科系，其他则是东京大学为博士级别或特殊资格人土开垦的研究科系。
东京大学的专业系别，如文学部下设：日本史、日本文学、文艺创意、中国文学、中国史、东洋哲学，其它如文学创作、欧洲文学、欧洲史、哲学等15个系别，学生入学一年之后，根据自己的爱好和特长申请转入各自的系别。理工科方面，理学部有：数理、自然科学、应用物理、化学生物；工学部有：化学、生物、系统情报、土木、航空航天。法学部有：法律、政治、公共政策。
经济学部有：经济、商业、统计、经营。农学部有：农学、畜产、园艺、生物环境、水产。医学部有：医学、牙医学、药学。
教养学部是为所有东京大学的新生入学第一年的基础性学习学院，使新生在共同学习文科及理科的基础课程的同时，逐渐的酝酿和明确自己今后学习的方向，一年后转入各自的学部继续深造。
